「収入」という言葉と、「所得」という言葉の意味は違います。
よく混同して使う方がいらっしゃいますが、これらは別物なので、注意しましょう。

	簿記会計	所得税(事業所得)	所得税(給与所得)
	収益	総収入金額	収入金額（年収）
	費用	必要経費	給与所得控除額
	--------	----------------	--------------
差引	利益	事業などの所得	給与所得

　上記の図でいうと、会計上の利益とは、収益−費用＝利益として計算されます。

同様に所得税では、総収入金額(収益)−必要経費（費用）＝事業などの所得（利益）、として計算されます。

給与所得の場合は、必要経費（費用）がありませんが、その代わりに「給与所得控除額」というのがありますので、収入金額（年収）−給与所得控除額＝給与所得、ということになります。

　つまり、税法用語でいうところの「所得」とは、簿記会計でいうところの「利益」のことであり、収入（年収）ではないのだ、と考えていただければ理解しやすいと思います。

（厳密にいうと「利益」と「所得」はちょっと違うのですが、だいたい同じものである、と考えていいでしょう。

興味のある方は、「租税論」という分野の本をお読みになることをお勧めします。）